Богословију Светог Петра Цетињског на Цетињу уписао је 2007. и завршио 2012. године са одличним успехом. Љубав према даљем усавршавању у богословској науци одвела га је на Богословски факултет Аристотеловог универзитета у Солуну, где је дипломирао у јуну 2017. године. У току студија у два наврата боравио је у Бечу, похађајући часове немачког језика. По повратку из Солуна ступио је као искушеник у братство манастира Ђурђеви Ступови код Берана. Монашки постриг примио је 7/20. новембра 2017. године из руку тадашњег Епископа будимљанско-никшићког г. Јоаникија, добивши име Пајсије по Светоме Пајсију Јањевцу, Патријарху српском. У чин јерођакона је рукоположен на Аранђеловдан, 8/21. новембра 2017. године. Са благослову надлежног епархијског архијереја академску 2018/19. годину је провео на студијском усавршавању у Санкт Петербургу, где је похађао часове руског језика, пратио наставу на Православној духовној академији и свештенослужио у Светотројицкој Александро-невској лаври. Исте године, 16/29. децембра, рукоположен је у чин јеромонаха у манастиру свога пострига. Вративши се из Русије, обављао је разна послушања у манастиру. За настојатеља манастира Ђурђеви Ступови постављен је на празник Часних верига Светог апостола Петра 16/29. јануара 2021. године.
После избора епископа Јоаникија за Митрополита црногорско-приморског, на његов позив, јеромонах Пајсије 1. јула 2021. године са делом братства прелази у Цетињски манастир. Послушање настојатеља манастира преузео је у септембру исте године, после устоличења дотадашњег игумана Епископа диоклијског Методија за Епископа будимљанско-никшићког. У достојанство протосинђела је произведен на празник Зачећа Светог Јована Крститеља, 23. септембра/6. октобра 2021. године, у Цетињском манастиру. У току школске 2022/2023. године, по одлуци Светог Архијерејског Синода Српске Православне Цркве, предавао је Свето Писмо Новог Завета и Агиологију у Богословији Светог Петра Цетињског. Од лета 2023. године налази се на годишњем студијском програму у Лондону, где похађа наставу енглеског језика. Говори новогрчки, руски, енглески и немачки, а служи се старогрчким и црквенословенским језиком.
На редовном заседању Светог Архијерејског Сабора Српске Православне Цркве, одржаном од 14. до 18. маја 2024. године у Београду, високопреподобни архимандрит Пајсије је изабран је за викарног епископа Митрополита црногорско-приморског са титулом Епископ диоклијски.